城市经济的研究不能就城市论城市。城市和区域是一个经济整体。城市与区域具有相互推动、相互依存和一起发展的机制与关系。城市是区域的中心和区域发展的动力源，区域是城市发展的基础和保障条件，又是城市服务的对象。因此，城市区域经济的研究是城市经济学研究的深化。从城市角度研究区域，从区域角度研究城市，这既是国际借鉴更是符合我国国情、加快城市经济发展的必然选择。城市经济学有义务、有责任为城市空间结构优化，为城市经济区的形成和发展，为农村城镇化的快速推进提供理论依照和实践指导。通过城市区域研究，有助城市经济区域观念的增强和就城市经济研究城市经济的纠偏，有助于我国城市化快速推进最佳途径的选择和不同观点的相互渗透及融合，有助于以城市为核心的区域共同市场的形成和规范，有助于城市经济中心作用的发挥和城乡经济的协调，有助于促进我国各级城市体系的建立和发展。有的学者研究城市经济缺乏区城观，把城市经济和区域经济看成是两个不同的体系，他们不同意农村城镇化的提法，将其与城市化对立起来，对城镇化提出质疑，认为与城市化一字之差，内涵却有原则的不同。实际上这是一个误区，是缺乏城市区域观的表现。为此，从城市经济学角度，研究城市区域更显得很重要了。否则窒息城市经济学科发展在所难免。

  3、城市化健康发展问题研究。城市化是城市经济学研究的重点。城市化是每个国家在实现现代化过程中必经的道路。我国在城市化加快速度进行发展过程中难免会出现了一系列需要我们来关注的问题：一是不少城市加速扩张生长的模式选择，依然延续着征地扩张的模式，没有跳出“摊大饼”的怪圈，造成居住用地越来越紧张。二是虚假城市化(spurious urbanization)。虚假城市化是指城市化水平超过经济发展和工业化水平，城市基础设施落后，又称过度城市化、超前城市化。三是城市生态环境恶化。四是城市生活新贫民化现象不断出现。针对我国当前城市化存在着的倾向性问题，十六届五中全会的《建议》特别强调我国城镇化必须“健康”发展。引导城市化的健康发展是“十一五”时期的重要议题，在我国“十一五规划”中，“推进城市化健康发展”是六大重点之一。促进城市化健康发展是我国实现可持续发展战略、构建社会主义和谐社会的重要工作内容。推进城市化健康发展，既是贯彻落实科学发展的必然要求，也是当今世界城市化可持续发展的普遍共识，也是人类生存的理想。因此，追求健康的城市化，应该是我们的当务之急。城市经济学理论工作者要重点研究怎么样处理好城市化进程中的城市适度规模与城市质量、城市生态和生态城市、城市健康和健康城市之间的关系；要研究城市化进程中的城市历史背景和文化特色保护；要研究城市化进程中如何破解“城中村”难题；要研究城市化进程中的城市贫困和反贫困问题；等等。

  4、城市竞争力问题研究。我国对城市竞争力的研究是近几年的事,有学者将我国城市竞争力研究的现状特点总结为“刚刚起步、起点较低、各自为政、一家之言”,总体上还未形成一个权威、科学、实用、统一的完整评价体系。当然，在一些主要的方面正趋向达成共识:城市竞争是财富(或价值)及其增长的竞争，但它又包括多个层面；评价城市竞争力的指标体系，必须建立一个令人信服的理论基础和理论框架,不能随意抽取指标进行组合；城市竞争力的许多关键指标是软指标，即问卷指标：既要研究城市竞争力的表现,又要研究构成要素。今后，以下几个方面要深入研究：一是要深入研究全球化、信息化的新知识经济背景下城市竞争的机制。二是在城市竞争机制分析的基础上，根据不同城市的竞争机制及影响城市竞争力的因素，建立科学合理的城市竞争力评价指标体系。三是要加强对城市竞争力空间效应的分析，包括全球层面、区域层面、城市层面的效应分析，为不同级别的政府决策提供依据。

  5、城市建设的规划与设计。当前，我国正处在快速工业化和城市化的发展阶段，资源、环境与发展的问题尤为突出，这就为作为政策工具的城市建设规划提出了更高的要求。但总体上看，我国城市规划的发展还远不能适应国家的城市发展的需求，更不能适应国家加快城市化战略的迫切需求。当前，城市建设中的诸多问题，如违法用地和违法建设屡禁不止；城市旧区、中心区超强度开发，建设密度过高，环境质量下降；城市新区开发随意性大，“开发区热”造成土地浪费；大城市交通不畅，环境污染加剧；区域性基础设施布局混乱；乡镇企业占用大量耕地等等，以及城市规划建设上的诸多败笔，如立意浅薄、贪大求洋、粗制滥造、疯狂克隆等，都给城市的发展带来创伤和遗憾。新形势下城市规划应加强城市建设创新性与国际性关系的研究，加强民间建筑与公共建筑协调性的研究，加强城市建设方法论的研究以及城市规划法制性与指导性的关系等间题的研究，以切实解决上述问题。

  6、城市可持续发展研究。21世纪是人类由褐色工业走向绿色文明的新世纪。党中央提出坚持以人为本，树立全面、协调、可持续的科学发展观，还原和阐释了人与自然和谐发展的哲学意义，为城市提供了一个基本的发展目标框架。随着可持续发展战略在我国的实施，迫切地要求作为生产力载体的城市走上可持续发展之路。城市可持续发展是城市发展的最佳选择，它既是城市发展的过程，也是城市发展的目标。城市可持续发展研究既是跟踪国际城市经济理论前沿研究的需要，也是从我国国情出发，促进城市经济快速、健康发展的客观要求。尤其是在全国贯彻实施《中国21世纪议程》，可持续发展研究成为热点的态势下，城市经济学理所当然要研究和实施可持续发展战略。一是可持续发展评估指标体系研究。可持续发展的内涵极其复杂，城市的可持续发展涉及环境、生态、资源、经济均衡和社会公平等多方面的协调发展。这就决定了其评估指标体系的建立将涉及多学科背景和复杂的方法论，可持续发展评估指标体系作为总体目标的分解和管理工作的依据，将有利于城市可持续发展的观念创新。二是资源、环境与发展问题研究。这涉及到以人为本的全面、协调、可持续发展如何在城市这一特定空间实现的研究，对作为政策工具的城市建设规划提出了更高的要求。因此，应加强城市建设创新性与国际性关系的研究，加强民间建筑与公共建筑协调性的研究，加强城市建设方法论的研究，以及城市规划法制性与指导性关系等问题的研究。